Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc3P33622 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms