Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd1P33215 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms