Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Saa4P31532 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms