Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd28P31041 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms