Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tacr1P30548 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms