Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BgnP28653 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BgnP28653 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BgnP28653 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BgnP28653 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BgnP28653 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BgnP28653 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BgnP28653 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BgnP28653 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms