Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms