Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb1P28230 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms