Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms