Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lef1P27782 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms