Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb2P27090 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfb2P27090 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms