Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms