Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UbtfP25976 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UbtfP25976 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UbtfP25976 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UbtfP25976 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms