Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms