Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsta3P23591 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms