Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms