Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms