Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcb1aP21447 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms