Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NefhP19246 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NefhP19246 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NefhP19246 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NefhP19246 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NefhP19246 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NefhP19246 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NefhP19246 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NefhP19246 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NefhP19246 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NefhP19246 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NefhP19246 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms