Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18530 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18530 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18530 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18530 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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