Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18528 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18528 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18528 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P18528 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18528 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18528 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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