Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsdP18242 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsdP18242 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms