Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd48P18181 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd48P18181 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms