Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs1P17533 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms