Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f1P17208 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms