Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim30aP15533 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms