Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Dnmt1P13864 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnmt1P13864 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms