Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms