Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms