Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnp2P11378 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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