Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spp1P10923 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spp1P10923 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms