Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CtsbP10605 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtsbP10605 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms