Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Amd1P0DMN7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms