Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms