Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefmP08553 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefmP08553 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefmP08553 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefmP08553 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NefmP08553 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefmP08553 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NefmP08553 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefmP08553 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefmP08553 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefmP08553 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms