Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TtrP07309 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtrP07309 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtrP07309 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtrP07309 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtrP07309 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtrP07309 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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TtrP07309 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtrP07309 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtrP07309 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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