Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms