Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms