Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms