Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-K1P01901 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-K1P01901 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-K1P01901 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-K1P01901 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms