Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacng2O88602 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng2O88602 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms