Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms