Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms