Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms