Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx7O70439 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx7O70439 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx7O70439 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx7O70439 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms