Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lnx1O70263 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lnx1O70263 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lnx1O70263 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lnx1O70263 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx1O70263 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx1O70263 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx1O70263 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx1O70263 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx1O70263 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx1O70263 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx1O70263 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx1O70263 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx1O70263 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx1O70263 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx1O70263 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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