Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxq1O70220 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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