Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms