Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms