Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp26a1O55127 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms